直流无刷电机可以像有刷直流电机那样以电源的接通或断开来实现起停控制。这种控制方法通常是用有触点开关直接完成。这种方法的缺点是起动电流比较大，电流过大容易引起过热和去磁问题，起动过快还会引起负载机械的冲击，所以只适用于小功率电机。

更常用的方法是用有触点开关接通控制器电源后，再通过对控制器的控制实现起动和停止，例如：

(1)在控制器设置有起停控制口(使能控制)，以逻辑电平来控制直流无刷电机的起动和停转。

(2)有调速功能的控制器，以转速控制指令电压的高低控制电机转速，常常取电零时电机停转。有些控制器有PWM信号接口，该信号占空比为零时电机停转。

(3)采用通/断位置传感器激励电源的方法。

直流无刷电机最好采用具有软起动功能的控制器，以降低电机起动时过大的电流冲击，转速能够平稳上升，减小转速的过冲，并以较短时间到达预定转速。常见的软起动是采用PWM方法。软起动驱动器通常使脉宽调制占空比从零开始上升，慢慢增加到较大，直至额定转速。然后，控制系统才转换到正常的位置、速度或转矩(电流)闭环控制。缓慢提升PWM占空比相当于缓慢増加施加于电机的电压，从而使起动电流限制到一个合适的水平。一般来说，50至几百毫秒的软起动斜坡足以限制电流的冲击。然而，有些大转动惯量直流无刷电机起动时软起动斜坡需要更长时间。